San Pedro de Alcántara es una localidad en la que el microclima de la Costa del Sol permite vivir muy bien prácticamente todo el año, con agradables temperaturas. Es un lugar en el que la temperatura media anual ronda los 20 grados, y donde las lluvias se dan con relativa frecuencia de noviembre a enero.
San Pedro de Alcántara tiene más de 300 días de sol al año, una temperatura que puede rondar en invierno los 14 grados durante el día de media, y en verano superar los 30 grados centígrados. Las lluvias son más frecuentes de noviembre a enero, los meses más fríos son enero y febrero y los más calurosos son junio, julio y agosto.
El clima de San Pedro de Alcántara es templado tirando a cálido, con una temperatura y una climatología mediterránea, donde las temperaturas extremas brillan por su ausencia.